本州に固有に分布する小型のドジョウ類で、湧水を水源とする細流、湿原や水田周りの小溝に生息する。湧水の枯渇、圃場整備、過度の農薬散布、宅地化により各地で急減している。

環境省　レッドデータブック”ホトケドジョウ”　より引用